Након отказа у Фенербахчеу, Мурињо је кратко време био без клуба, да би уследио контакт и преговори са славним клубом из Лисабона.
По свему судећи, Жозе ће после 25 година поново бити тренер Бенфике, клуба у ком је све почело. После Барселоне у којој је у периоду од 1996. до 2000. био помоћних сер Бобија Робсона, обрео се 2000. на клупи Бенфике.
Лисабонски Орлови нису часили часа после шокантног пораза од Карабага на премијери Лиге шампиона. Водила је Бенфика раним головима са 2:0, да би до краја меча претрпела истински шок и пораз резултатом 3:2.
Управа клуба експресно је сменила Бруна Лажа, и позвала Жозеа Муриња, ком јесте први тим била Бенфика, али је највеће успехе бележио управо са Портом. Освојио је са клубом са Драгаа Лигу шампиона, после чега је преузео лондонски Челси.
Мурињо и Бенфика потписаће двогодишњи уговор, који ће бити на снази до јуна 2027. године.