Федерални истражни биро, Централна обавештајна агенција, Агенција за националну безбједност и Управа за трезор истраживали су Флинове контакте, али није јасно када је истрага почела, да ли је завршена и какви су резултати, пише лист „Волстрит џурнал“ позивајући се на неименоване изворе.
Лист наводи да је циљ истраге био да се открије природа Флинових контаката са руским званичницима и то да ли су они били противзаконити.
Истрага је, наводно, била усмерена на Флинов телефонски позив руском амбасадору у Сједињеним Америчким Државама Сергеју Кисљаку 29. децембра 2016, када је амбасадор позвао Флина да учествује у мировним преговорима о Сирији у Астани.
Бела кућа је, наводно, негирала било какво сазнање о истрази и да ли је било основа за истрагу.
Флин није једини члан Трампове администрације чије су се везе са Русијом суочиле са интензивном провером. Трампов државни секретар, Рекс Тилерсон, морао је да поднесе детаљан извештај о својој потенцијалној политици према Русији у својој расправи пред Конгресом док су медији доводили у питање његове везе са Москвом.
