Митрополит је сугерисао политичарима власти да пре доношења одлуке о НАТО-у питају Светог Петра Цетињског да ли то подржавају сви грађани Црне Горе. Одговарајући на поруке Ђукановића да ће Митрополија црногорско-приморска (МЦП) добити своју нишу, митрополит је оценио да председник ДПС не зна шта говори и да нема појма о цркви.
„Господин Ђукановић је био главна личност у свим историјским збивањима у Црној Гори од деведесетих година прошлог века. Између осталог, њега зову и Мило краљ. И заиста, очигледно се он и понаша тако, као краљ. Да ли му је својствен онај апсолутизам краља Николе Првог Петровића, то није моје да судим. Међутим, постоји једна суштинска разлика између нашег црногорског краља и краља Николе. Краљ Никола је био крштен човек, човек цркве и у његово време Митрополија црногорско-приморска је била државна вера. Наш нови краљ био је овде и код ћивота Светог Петра. Морам да признам да није умео да се понаша. То му не замерам, таква му је била школа кумровачко-брозовачка. Пришао је ћивоту и климнуо главом, као што сада климају у џамији, тако некако. Онда је после чак и ложио бадњаке. Међутим, нису Цетињани заборавили да је Мило наопако наложио бадњаке“, подсетио је митрополит.
Он тврди да је Ђукановић искористио Цркву да би учврстио власт и да би остварио своје политичке циљеве. У том духу, он наставља ту причу, коју је радикализовао 1997. године када је почео другачије да се понаша према цркви и почео да подржава такозвану ЦПЦ.
„Ђукановић ме је оптужио да сам политичар у мантији и најавио да ће закон о верским заједницама бити донет у догледно време, а да ће црква, односно Митрополија, добити своју ’нишу‘. Не знам шта подразумева под тим… Он смешта Светог Петра Цетињског, Светог Василија Острошког у нишу?! Није свестан шта говори, а опрашта му се јер у Бога не верује, па може да каже и нешто што је детињасто и неразумно. Он хоће сву историју да смести у нишу. Очевидно је да Римокатоличка црква није добила нишу, с њом је склопљен темељни уговор, а тако је учињено и с Исламском заједницом и с јеврејском заједницом. Све је то за поштовање, али не знам колико је за поштовање да МЦП на крају свега тога заслужи неку нишу, док су друге заједнице добиле сва своја права. Ђукановић очигледно има харизму као политичар, али с друге стране појма нема о цркви“, сматра преосвећени митрополит Анфилохије.
Што се тиче протеста, који организовао Демократски фронт на Цетињу, он сматра да је то њихов политички скуп са којим црква нема везе.
„Ја сам дужан пред Богом, пред својом савешћу и ћивотом Светог Петра Цетињског да данас поводом тог насиља и злочина НАТО-а одржим заупокојену литургију и помен свима пострадалима и у Србији, и у Црној Гори, као и жртвама од Украјине до Азије. Исто то ћемо урадити и 7. маја за око 2.000 побијених у Подгорици. НАТО бомбардовање Црне Горе, Србије и некадашње заједничке државе је директни наставак нацифашистичке тираније из времена Другог светског рата. Носилац такве тираније је НАТО. Када би се тај НАТО сада покајао пред Богом и пред људима и обновио оно што је уништио, онда би то било добро. Кад је у питању доношење одлуке власти о НАТО-у на Цетињу, добро је да се она доноси на Цетињу, јер је то престони град који је био и остао темељ Црне Горе. Међутим, када бих ја био на њиховом месту, као што нисам, онда бих ја дошао код Светог Петра Цетињског да га приупитам како они раде и усмеравају Црну Гору, је ли то у његовом духу. Приупитао бих ја и Петра Другог о томе. Било би добро када доносе ту одлуку да приупитају је ли то из главе целог народа или је из главе само једне групе људи, и да ли та група људи има право пред Богом и Светим Петром Цетињским и историјом Црне Горе да преузима такву одговорност на себе“, закључио је он.