Теоретичари завера често спекулишу о бројним тајнама НАСА у 60 година њене историје, а оптуживали су агенцију за разне ствари — од лажирања слетања на Месец до прикривања доказа постојања ванземаљског живота.
НАСА има тим стручњака и огромну пи-ар агенцију која системски оповргава то као митове, али су се током година појавиле бројне тајне и чињенице које захтевају одговор, ако не и објашњење.
1. Прекид емитовања уживо
Постоји нешто врло сумњиво у вези са НАСА што је заинтригирало велики број људи. Наиме, у октобру 2016. НАСА је напрасно прекинула свој „лајв фид“, а пре него је то учинила, могло се видети бизарно мистериозно биће које је ухватила сателитска камера. Било је то врло необично. Иако је НАСА објавила фотографије, очигледно је да потајно ради на нечему о чему ћути пред светом. Кад се затражило објашњење, стигао је одговор да је реч о нормалном метеору какав се може видети скоро сваког дана, уз тврдњу да нема ничег посебног на том снимку.
2. Избрисани снимци слетања на Месец
Од дана приказивања слетања на Месец уживо на телевизији, НАСА је оптуживана за лажирање целог догађаја уз низ аргумената — на снимку се не виде звезде, застава се вијори, откуда на Месецу стена са словом „Ц“, како су на Месецу сенке различитих дужина… Наметала су се и бројна друга питања. Када је агенција 2006. признала да не може да пронађе оригиналне снимке тог слетања из 1969, сумње да је све била једна велика муљажа опет су се појачале. НАСА ипак не одступа од своје приче, а касније су из те агенције објавили да су пронашли неке изгубљене видео-записе, али да су их, људском грешком и због кресања буџета — преснимили.
3. Телескоп „Џејмс Веб“
Обичај било које суперсиле јесте да финансира истраживање свемира, свиђало јој се то или не — јер то је демонстрација моћи, технологије и повољних финансија које је уздижу изнад других. Међутим, изгледа да такви пројекти не иду баш увек по плану, као што је ситуација с изградњом „Џејмс Веб“ телескопа, са којом се започело пре око 20 година и који је требало да буде спреман за лансирање 2007. Међутим, довршен је тек 2017. Пројект је у почетку требало да кошта пола милијарде долара, али је на крају коштао чак 17 пута више — око 8,8 милијарди. Сада, кад је телескоп спреман, опет остаје питање колико ће још времена протећи пре него га стварно лансирају. Лансирање се, наводно, планира за октобар 2018.
4. Нуклеарна тестирања на Месецу
Совјети су одувек били огромна конкуренција Сједињеним Америчким Државама, а раздобље напетости је трајало дуже време. САД су покушавале да доказују своју супериорност не само на подручју машинства већ и кроз упознавање других свемирских тела и објеката. Књижевник који ради биографију астронома Карла Сагана је у свом истраживању наишао на невероватне ствари, попут пројекта А-119 који је, наводно, изгледао као план САД да се Месец претвори у место за тестирање нуклеарног оружја. Јесу ли стварно горе нешто тестирали или не, немогуће је знати.
5. Операција „Спајалица“
Други светски рат био је велики изазов за свет, али и за САД. Сваки бољи познавалац историје зна да је међународно понашање након Другог светског рата било, благо речено, мутно. Усред целог хаоса, ЦИА је у својој „Операцији спајалица“ регрутовала најбоље нацистичке умове. Циљ је био домоћи се научника из поражене нацистичке Немачке.
То су били највећи стручњаци из нацистичке ратне индустрије, медицине и одељења хемијског оружја. Претпоставка је била — ако их не узмемо ми, узеће их Руси. Скоро 1.600 талентованих и успешних нацистичких научника, лекара и инжењера добило је визе, постали су амерички држављани и до краја живота угодно живели.
Неки од научника који су на тај начин регрутовани су ракетни инжењери — есесовац Вернер фон Браун (творац славног нацистичког далекометног пројектила В-1 и В-2) и Артур Рудолф, директор концентрационог логора, где је 20.000 јеврејских и пољских радника умрло од премлаћивања, глади и вешања. Обојица су добила америчко држављанство.
Под вођством Вернера вон Брауна изграђено је у САД неколико нових типова ракета-носача за свемирске летове, а управо он је главни конструктор „Сатурна 5“, ракете коришћене у мисијама „Аполо“ за одлазак на Месец с људском посадом.
У Америку је стигао лекар и истакнути медицински истраживач Хубертус Стругхолд. На Нирнбершком суду извукао се без казне сведочећи против својих колега, а већ 1947. године пребачен је у САД, где је након неколико година добио и америчко држављанство. За време рата био је надлежан за обуку лекара који су изводили експерименте над Јеврејима у Дахау. У САД је био високо позициониран и у америчком ратном ваздухопловству и у НАСА, изградио је сјајну научну каријеру, а познат је и као „отац свемирске медицине“.