Ђукановић тврди да је „неупитно“ да је постојала аутокефална „црногорска православна црква“ и да је „неупитно“ право актуелне Црне Горе да крене у операцију обнове такозване „црногорске православне цркве“.
Он је за Јавни сервис Црне Горе додао да су Митрополији црногорско-приморској и њеном свештенству широм отворена врата да буду део тог решења, а не да — „традиционално остану део проблема“.
Он каже и да је Српска православна црква — важан фактор подељености православног становништва у Црној Гори.
Коментаришући писмо Васељенског патријарха Вартоломеја, Ђукановић је рекао да га је добио недељу дана након што га је објавила Митрополија црногорско-приморска и да га садржај писма упућује на то да је писано у Црној Гори.
Он сматра да је држава у случајевима цркве на Румији и крстионице на Михољској Превлаци показала „вишак толеранције“ и — да убудуће неће бити тако.
„Правни систем ће морати да се поштује и свако мора да разуме да ће бити лојалан грађанин држави у којој живи и ради, или ће бити преступник. Преступници могу бити и у оделима и у мантијама и завршиће у затворским униформама, јер то је судбина преступника“, закључио је председник Црне Горе.