Ракета се одвојила од лансирне платформе у 11.05 часова по московском времену, а 530 секунди након узлетања модул „Сојуз-2.1а“ одвојио се од трећег степена носача, што је неопходно како би се извео у орбиту.
Посаду чине космонаути „Роскосмоса“ Анатолиј Иванишин и Иван Вагнер, као и астронаут НАСА Крис Кесиди. Они ће провести на Међународној свемирској станици шест месеци.
Ово је први лет свемирског брода „Сојуз МС-16“ до Међународне свемирске станице. Приближавање брода орбиталној станици одвијаће се по шесточасовној шеми, а пристајање је планирано у 17 часова и 16 минута по московском времену.
Посада ће током боравка у свемиру обавити бројне научне експерименте који нису повезани са изласком у космос. Чланови посаде ће преузети два теретна брода „Прогрес“, јапански ХТВ 3 и амерички „Цигнус“.
Припрема за лансирање у Бајконуру одвијала се под строгом контролом због пандемије коронавирусне инфекције.
